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SC-XRD應(yīng)用分享 | 藥物分子手性,構(gòu)型測(cè)定

更新時(shí)間:2023-11-28點(diǎn)擊次數(shù):1443

在化學(xué)藥物研究中,有一類藥物為手性的藥物,確定藥物手性基團(tuán)構(gòu)型是需要解決的關(guān)鍵問(wèn)題,手性問(wèn)題會(huì)直接影響藥物的療效與毒副作用。手性創(chuàng)新藥物指導(dǎo)原則中明確規(guī)定:“手性的藥物分子構(gòu)型測(cè)定的直接方法為單晶X射線結(jié)構(gòu)分析"。對(duì)于一般非手性創(chuàng)新藥物而言,也要求有單晶X射線衍射結(jié)構(gòu)分析結(jié)果。對(duì)于測(cè)定分子的構(gòu)型,目前晶體學(xué)界普遍采用是H.D. Flack教授在1983年提出的方法。由于手性晶體對(duì)X射線具有反常散射的信號(hào),通過(guò)測(cè)定反常散射信號(hào),可以計(jì)算Flack系數(shù),進(jìn)而得到分子的構(gòu)型。室內(nèi)衍射儀常用Cu靶進(jìn)行藥物分子的構(gòu)型測(cè)定。相對(duì)于其它分析手性的分析方法,X射線單晶衍射更加直接和可靠。

 

分子手性

基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)

除了小分子藥物晶體結(jié)構(gòu),X射線單晶衍射另一個(gè)主要的用途是解析藥物前導(dǎo)分子和靶標(biāo)蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。傳統(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)主要是依靠細(xì)胞和動(dòng)物模型,一般是表型篩選。就像好多中藥一樣,我們藥物有效,但是卻不知道藥物為什么有效。隨著分子生物學(xué)包括結(jié)構(gòu)生物學(xué)的快速發(fā)展,小分子藥物發(fā)現(xiàn)進(jìn)入基于分子靶點(diǎn)的時(shí)代。也就是,我們能夠基于某個(gè)分子靶點(diǎn)進(jìn)行高通量篩選。但是傳統(tǒng)的高通量篩選工作(HTS)是基于藥物分子庫(kù),進(jìn)行廣篩,依靠數(shù)據(jù)分析得出結(jié)果,不僅耗時(shí)而且耗費(fèi)大量資源,成本和效率都不能滿足現(xiàn)代藥物研發(fā)的需要。在現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)方法中,我們可以獲得靶標(biāo)蛋白的結(jié)構(gòu),以及小分子前導(dǎo)藥物與靶標(biāo)蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu),清晰的看到小分子藥物的作用方式。也就是說(shuō)不再靠著盲篩,廣撒網(wǎng),而是在結(jié)構(gòu)的指引下,有針對(duì)性,有目的性的進(jìn)行改造?;诮Y(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì),在計(jì)算機(jī)的幫助下,變得非常清晰和直接了當(dāng)。因此,高通量篩選、虛擬篩選、基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)、以及先導(dǎo)化合物的優(yōu)化成為小分子藥物發(fā)現(xiàn)的常見技術(shù)。這些技術(shù)取得了很大的成功,現(xiàn)在仍然在不斷豐富和發(fā)展當(dāng)中。其中晶體結(jié)構(gòu)在指導(dǎo)性方面,起著至關(guān)重要的作用。

藥物靶標(biāo)蛋白復(fù)合物結(jié)構(gòu)的測(cè)定(https://www.researchgate。。net/)

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